Wesentliche Auswahlkriterien für die Preisvergabe sind:
Über die Vergabe des Innovationspreis Münsterland entscheidet ein unabhängiges Gremium aus Wissenschaft und Wirtschaft.
Dr. sc. nat. Dr. h. c. mult. Johannes Georg Bednorz
IBM Research Zürich
Nobelpreisträger für Physik 1987
Dr. Benedikt Hüffer
Präsident der Industrie- und Handelskammer Nord Westfalen
Hans Hund
Präsident der Handwerkskammer Münster
Prof. Dr. Bernd Kriegesmann
Präsident der Westfälischen Hochschule
Prof. Dr. Monika Stoll
Prorektorin für Forschung der Wilhelms-Universität Münster
Prof. Dr. Ute von Lojewski
Präsidentin der Fachhochschule Münster